Posso usar a mesma Variação Fiscal para NF-e e NFC-e?

Sim, desde que o conteúdo seja compatível com ambos os tipos de nota. No cadastro, você pode marcar os dois tipos ("NF-e" e "CF-e") para que ela seja aplicada em ambas. No entanto, atente-se aos impostos e CFOPs específicos de cada operação.